X32(v4.13)とS16(v3.0)を2台で検証しましたところ、下記状況でございました。
パターン①
1台目のS16の電源を入れる
2台目のS16の電源を入れる
→2台目を認識しない
パターン②
1台目のS16の電源を入れる
2台目のS16の電源を入れる
1台目のS16の電源を入れ直す
→2台目を認識する
パターン③
2台目のS16の電源を入れる
1台目のS16の電源を入れる
→2台目を認識する
1台目と2台目を入れ替えても結果は同じで、パターン②、③であれば2台とも認識することを確認いたしました。
S16のファクトリーリセットはございませんが、CONFIGの初期化でしたら「CONFIGボタンを押しながら電源を入れる」となります。